Référentiels
Les référentiels sont des bases de données dont l’objectif est de parler un langage commun en utilisant des normes afin de faciliter le partage de la connaissance. Ils sont mis en place par le Muséum National d’Histoire Naturelle (MNHN) et permettent l’interopérabilité et la communication entre les utilisateurs de la donnée naturaliste.
Sigogne utilise plusieurs référentiels nationaux, dans leurs versions les plus à jour :
- TaxRef, référentiel taxonomique de la faune, la flore et la fonge de France métropolitaine et d'outre-mer. Il permet de lister, organiser et codifier les noms scientifiques et vernaculaires des espèces présentes sur le territoire.
- HabRef, référentiel des typologies d'habitats naturels et des végétations de France métropolitaine et d'outre-mer. Il permet de standardiser et classer toutes les typologies officielles (CORINE biotopes, EUNIS, Cahiers d'habitats, Prodrome des végétations de France...) et de constituer un socle de connaissance des habitats.
Standards
La modélisation de la base de données de la plateforme est basée sur les standards nationaux.
Les standards permettent une meilleure homogénéité dans les lots de données en définissant un format d’échange commun. Les données sont alors partagées selon des concepts et des règles d’écriture communes, ce qui facilite leur bonne compréhension. Les standards sont produits par l'UMS PatriNat, le centre d'expertise et de données sur le patrimoine naturel.
Sigogne utilise plusieurs standards nationaux :
- Occurrences de taxons pour les données d'observations d'espèces et Occurrences d’habitats pour les données d'observations d'habitats, permettant d'alimenter le SINP national. Les taxons sont liés au référentiel TaxRef et les habitats au référentiel HabRef. Il s'agit d'un format spécifique pour l'échange de données entre plateformes SINP.
- Occurrence de taxons pour la plateforme thématique (adapté pour correspondre à la modélisation de la base de données Sigogne), permettant les échanges avec les chefs de file.
- Métadonnées
Listes régionales de sensibilité
Les données sensibles sont des données qui ne doivent pas être largement diffusées pour éviter de porter atteintes aux éléments qu’elles concernent (L.124-4 du code de l'environnement). Les espèces observées en région sont soumises à évaluation dans l'objectif d'établir une liste d'espèces sensibles et de définir un niveau de diffusion pour chacune d'entre elles. Les listes régionales de Bourgogne-Franche-Comté ont été validées par le CSRPN et sont disponibles au format standard national en cliquant sur ce lien. Ces fichiers ont été construits à partir du standard d'échange pour la transmission des listes régionales de sensibilité, produit par l'UMS PatriNat.
L'onglet RefSensibilite liste les espèces sensibles à partir de leur code taxon de référence (CD_NOM, CD_REF) et leur attribue un code de sensibilité (CD_SENSIBILITE). Les niveaux de diffusion autorisés d'après leur code de sensibilité sont les suivants :
- 0 : Espèce non sensible, diffusion à la précision maximale telle que saisie
- 1 : Diffusion département, maille, commune, ZNIEFF
- 2 : Diffusion département et maille 10x10 km
- 3 : Diffusion département seulement
- 4 : Aucune diffusion (cas exceptionnel)
La sensibilité s'applique majoritairement sur l'ensemble du territoire de Bourgogne-Franche-Comté mais il existe quelques cas particuliers d'espèces pour lesquelles celle-ci n'est effective que sur l'une des deux anciennes régions (Bourgogne ou Franche-Comté). Ainsi, pour chaque espèce, le territoire d'application de la sensibilité est précisé en indiquant le code région (CD_ADMINISTRATIF) :
- 27 : Bourgogne-Franche-Comté
- 26 : Bourgogne
- 43 : Franche-Comté
L'onglet RefSensibilitéMtd contient les références bibliographiques des listes de sensibilité.
La liste des espèces sensibles en Bourgogne-Franche-Comté est également disponible au format PDF.
Listes rouges
Les listes rouges évaluent le statut de menace, établi initialement par l'UICN aux niveaux mondial, européen et national, et décliné au niveau régional.
Listes rouges régionales
En Bourgogne
Les statuts de listes rouges de Bourgogne diffusés sur Sigogne sont issus des listes suivantes :
- Amphibiens : Varanguin, N. 2014. Elaboration d'une liste rouge des Amphibiens de Bourgogne. Société d'Histoire naturelle d'Autun. 21 pp.
- Mousses : Bardet O. 2021. Liste rouge régionale des bryophytes de Bourgogne. Rapport méthodologique. Conservatoire botanique national du Bassin Parisien. Paris. 46 p.
- Chauves-souris : Jouve, L. & Cartier, A. 2015. Elaboration d'une liste rouge des Chiroptères de Bourgogne. Action R20 du Plan régional d'actions pour les Chiroptères de Bourgogne 2011-2015. Société d'Histoire naturelle d'Autun. 8 pp.
- Crustacés : Lerat, D. 2015. Elaboration d'une liste rouge des Ecrevisses de Bourgogne. Société d'Histoire naturelle d'Autun. 12 pp.
- Libellules : Ruffoni, A. 2015. Elaboration d'une liste rouge des odonates de Bourgogne. Action I2 de la déclinaison régionale du plan national d'actions en faveur des odonates de Bourgogne 2013-2017. Société d'Histoire naturelle d'Autun, Société française d'Odonatologie et Groupe odonates Bourgogne. 11 pp.
- Papillons de jour et zygènes : Ruffoni, A. 2015. Elaboration d'une liste rouge des Rhopalocères et Zygènes de Bourgogne. Société d'Histoire naturelle d'Autun. 11 pp.
- Mammifères : Lerat, D. 2014. Elaboration d'une liste rouge des Mammifères hors Chiroptères d Bourgogne. Société d'Histoire naturelle d'Autun. 23 pp.
- Oiseaux : Abel, J., Babski, S.-P., Bouzendorf, F. & Brochet, A.-L. 2015. Liste rouge régionale des oiseaux nicheurs menacés en Bourgogne. Etude et Protection des Oiseaux en Bourgogne, LPO Côte-d'Or. 16 pp.
- Plantes : Anonyme. 2015. Liste rouge de la flore de Bourgogne. CBNBP. Fichier excel.
- Reptiles : VARANGUIN, N., 2014. Élaboration d'une liste rouge des Reptiles de Bourgogne - Dossier de synthèse. Ed Soc. Hist. Nat. Autun, 16 p. plus annexes
En Franche-Comté
Les statuts de listes rouges de Franche-Comté diffusés sur Sigogne sont issus des listes suivantes :
- Champignons : Sugny, D., Beirnaert, P., Billot, A., Caillet, M., Caillet, M., Chevrolet, J.-P., Galliot, L., Herbert, R. & Moyne, G. 2013. Liste rouge des champignons supérieurs de Franche-Comté. Publication commune Fédération Mycologique de l'Est, Conservatoire National Botanique de Franche-Comté et Société Botanique de Franche-Comté. 114 pp.
- Chauves-souris : ROUE, S.Y. 2007. Proposition de liste rouge pour les chiroptères en Franche-Comté. Pub. CPEPESC Franche-Comté, 1 p.
- Insectes : Anonyme. 2013. Listes rouges régionales d'insectes de Franche-Comté Libellules (Odonates), Criquets, Sauterelles et Grillons (Orthoptères), Papillons de jour (Rhopalocères & Zygènes) et Mantes (Mantidés). Évaluation du risque de disparition selon la méthodologie et la démarche de l'UICN. CBNFC, Observatoire Régional de invertébrés, Opie Franche Comté. 12 pp.
- Oiseaux : Giroud, I., Paul, J.-P., Chalvin, L., Maas, S., Giroud, M., Coeurdassier, M., Cretin, J.-Y., Michelat, D. & Louiton, F. 2017. Liste rouge des oiseaux nicheurs de Franche-Comté. LPO Franche-Comté, DREAL Bourgogne-Franche-Comté, Conseil régional de Bourgogne-Franche-Comté. 24 pp.
- Plantes : Ferrez, Y. 2014. Liste rouge régionale de la flore vasculaire de Franche-Comté. Évaluation du risque de disparition selon la méthodologie et la démarche de l'UICN. CBNFC, Observatoire régionale des Invertébrés. 12 pp.
- Mousses : Bailly G. (coord.), 2021. Liste rouge des bryophytes de Franche-Comté (Version 3). Les Nouvelles archives de la Flore jurassienne et du nord-est de la France, n°18, p : 3-26.
- Poissons : Anonyme. 2014. Liste rouge des espèces de poissons menacées en Franche-Comté. 5 pp.
- Mammifères : Paul, J.-P. 2008. Liste Rouge des Mammifères (hors Chiroptères), Oiseaux, Reptiles et Amphibiens en Franche-Comté. LPO Franche-Comté. 19p.
- Amphibiens et reptiles : Bideau, A., Michon, A., Vaniscotte, A., Pinston, H., Cottet, M., Giroud, I., Bannwarth, C., Paul, J.-P. & Mora, F. 2020. Listes rouges des Amphibiens et des Reptiles de Franche-Comté. LPO Franche-Comté, DREAL Bourgogne-Franche-Comté, Conseil régional de Bourgogne-Franche-Comté. 29 pp. + annexes.
Liste rouge nationale
Les statuts de liste rouge nationale diffusés sur Sigogne sont issus des listes suivantes :
- Crustacés : UICN France & MNHN. 2014. La Liste rouge des espèces menacées en France - Chapitre Crustacés d'eau douce de France métropolitaine. Paris, France
- Papillons de jour : UICN France, MNHN, Opie & SEF (2012). La Liste rouge des espèces menacées en France - Chapitre Papillons de jour de France métropolitaine. Dossier électronique.
- Éphémères : UICN France, MNHN & OPIE. 2018. La Liste rouge des espèces menacées en France - Chapitre Ephémères de France métropolitaine. Paris, France. 2 pp.
- Libellules : UICN France, MNHN, OPIE & SFO (2016). La Liste rouge des espèces menacées en France - Chapitre Libellules de France métropolitaine. Paris, France.
- Mammifères : UICN France, MNHN, SFEPM & ONCFS. 2017. La Liste rouge des espèces menacées en France - Chapitre Mammifères de France métropolitaine. Paris, France. 15 pp.
- Mollusques : UICN Comité français, OFB & MNHN (2021). La Liste rouge des espèces menacées en France – Chapitre Mollusques continentaux de France métropolitaine. Paris, France. 15 pp.
- Oiseaux : UICN France, MNHN, LPO, SEOF & ONCFS (2016). La Liste rouge des espèces menacées en France - Chapitre Oiseaux de France métropolitaine. Paris, France.
- Plantes : Anonyme 2018. La Liste rouge des espèces menacées en France - Chapitre Flore vasculaire de France métropolitaine. Fascicule. UICN France, FCBN, AFB & MNHN. Paris, France. 32 pp.
- Poissons : UICN comité français. 2019. La Liste rouge des espèces menacées en France – Chapitre Poissons d'eau douce de France métropolitaine. Fascicule. UICN France, MNHN, SFI & AFB. Paris, France. 16 pp.
- Amphibiens et reptiles : UICN France, MNHN & SHF (2015). La Liste rouge des espèces menacées en France - Chapitre Reptiles et amphibiens de France métropolitaine. Paris, France.